Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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PTPROQ16827 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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PTPROQ16827 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPROQ16827 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPROQ16827 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPROQ16827 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPROQ16827 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPROQ16827 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PTPROQ16827 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PTPROQ16827 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PTPROQ16827 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PTPROQ16827 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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PTPROQ16827 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPROQ16827 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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