Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITSN1Q15811 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms