Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIP10Q15642 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms