Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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HERC3Q15034 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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