Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IHHQ14623 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IHHQ14623 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IHHQ14623 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms