Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSTA3Q13630 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSTA3Q13630 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms