Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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