Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 RLN2-201ENST00000381627 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms