Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ATRQ13535 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ATRQ13535 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRQ13535 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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