Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP3Q12983 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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BNIP3Q12983 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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