Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NPRL3Q12980 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms