Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIF5AQ12840 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms