Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
REG3AQ06141 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms