Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms