Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GSCP56915 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GSCP56915 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSCP56915 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms