Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSE1LP55060 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms