Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PGGT1BP53609 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1BP53609 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1BP53609 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1BP53609 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1BP53609 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1BP53609 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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