Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms