Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HOXA1P49639 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms