Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms