Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCAP28676 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCAP28676 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCAP28676 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCAP28676 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCAP28676 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCAP28676 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCAP28676 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCAP28676 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms