Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB4P28070 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms