Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms