Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms