Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LDLRP01130 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LDLRP01130 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LDLRP01130 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LDLRP01130 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LDLRP01130 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LDLRP01130 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LDLRP01130 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LDLRP01130 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LDLRP01130 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LDLRP01130 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LDLRP01130 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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