Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms