Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms