Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BIVM-ERCC5R4GMW8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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