Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHKBQ9Y259 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms