Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMG5Q9UPR3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms