Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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