Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms