Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ELL3Q9HB65 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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