Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOPXQ9BPY8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOPXQ9BPY8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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