Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LINC00208Q96KT6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms