Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXD4L4Q8WXT5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms