Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LNX2Q8N448 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.4 ms