Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms