Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FHOD3Q2V2M9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FHOD3Q2V2M9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms