Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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