Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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