Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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ZNHIT3Q15649 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ZNHIT3Q15649 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ZNHIT3Q15649 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ZNHIT3Q15649 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ZNHIT3Q15649 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ZNHIT3Q15649 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ZNHIT3Q15649 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNHIT3Q15649 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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