Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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