Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CNGB1Q14028 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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CNGB1Q14028 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB1Q14028 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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