Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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