Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RBBP4Q09028 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms