Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms