Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PGGT1BP53609 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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