Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARCN1P48444 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms