Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC1A1P43005 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms